生物物理

巻頭言

研究テーマの選択

安藤敏夫

2014 年 54 巻 3 号 p. 129
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.129

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解説

キネシン型分子モーターの構造変化と動作機構

仁田亮

2014 年 54 巻 3 号 p. 133-139
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.133

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Molecular motor kinesins move processively along microtubules by using energy derived from ATP hydrolysis. Almost all of the intermediate structures of this ATPase reaction cycle have been solved for the monomeric kinesin KIF1A. Based on this structural information, we present here the common atomic mechanisms of kinesin motility, which can be applied not only to the monomeric kinesins but also to the dimeric kinesins. Structural studies have suggested that kinesins accomplish their mission by utilizing the evolutionary conserved strategy among the various ATPases/GTPases/kinases in which they use the energy from the ATP/GTP hydrolysis to attach/detach to/from their effectors.

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サイズの発生学―濃度勾配のスケーリング―

猪股秀彦, 柴田達夫

2014 年 54 巻 3 号 p. 140-145
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.140

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The Spemann organizer secretes the anti-BMP protein Chd, and provides dorsal positional information by inactivating the ventralizing signals BMPs in a spatially graded manner. Several studies have shown that a morphogenetic field exhibits a strong tendency of self-regulation. For instance, when a blastula embryo is bisected across the D-V axis, the dorsal half develops into a well-proportioned half-size embryo, which retains a nearly normal DV ratio. These observations indicate that the BMP activity gradient is dynamically and flexibly regulated in response to changes of the embryonic size. Here we demonstrate that the auto-regulatory loop of Chd degradation plays a decisive role in scaling.

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総説

人工細胞を使って膜タンパク質を「進化」させる技術の開発

藤井聡志, 松浦友亮, 四方哲也

2014 年 54 巻 3 号 p. 146-149
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.146

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Although several methods of in vitro directed evolution have been developed, they were applied to globular proteins, but not to membrane proteins. Liposome display is a novel method, which enables the directed evolution of membrane protein in vitro. Membrane protein was synthesized by the cell-free translation system in a cell-sized liposome, and its function was probed by a fluorescence indicator. Liposome with high fluorescence intensity was selected by a cell sorter, enabling the isolation of DNA encoding the evolved protein. Here, we show the application of this method to α-hemolysin, one of the membrane proteins from Staphylococcus aureus.

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受容体型チロシンキナーゼにおける膜を介した情報伝達のしくみ

佐藤毅

2014 年 54 巻 3 号 p. 150-153
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.150

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Receptor tyrosine kinase is a membrane protein that regulates cell growth and differentiation. Ligand binding to the extracellular region triggers its function as a kinase in the intracellular region. Yet, it is still not known how the “signal” encoded by ligand binding to the receptor is transmitted across the membrane. Answering this fundamental question requires analysis in detail on the transmembrane and the juxtamembrane regions of the receptor. This review focuses on recent progress in structural work for these regions to understand the activation mechanism of EGFR, arguably one of the most intensively studied membrane receptors.

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脂質ラフトは熱力学的に説明できるのか？―非調和融点型固液相図とクラスター形成―

玉井伸岳, 後藤優樹, 松木均

2014 年 54 巻 3 号 p. 154-157
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.154

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We have recently studied the thermotropic phase behavior of cholesterol-containing binary bilayers of a homologous series of linear saturated phosphatidylcholines (CnPCs) with different hydrocarbon-chain lengths n (n = 14-18) using the Prodan fluorescence spectroscopy and differential scanning calorimetry to construct temperature-composition phase diagrams for those binary bilayers. This review describes our concept on the miscibility between cholesterol and CnPC on the basis of the experimental phase diagrams as well as the distribution of cholesterol within the bilayers derived by applying the so-called superlattice model.

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トピックス

N型糖鎖修飾におけるアスパラギン側鎖アミド基の活性化機構の構造基盤

松本俊介, 神田大輔

2014 年 54 巻 3 号 p. 158-159
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.158

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生体発光共鳴エネルギー転移を用いた生細胞内でのミトコンドリアタンパク質間相互作用解析

佐々木理, 小柴琢己

2014 年 54 巻 3 号 p. 160-162
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.160

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KCOMBUを用いた低分子構造比較と予測

川端猛

2014 年 54 巻 3 号 p. 163-165
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.163

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理論/実験技術

タンパク質の柔らかな運動を誘起する分子シミュレーション

原田隆平, 北尾彰朗

2014 年 54 巻 3 号 p. 167-171
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.167

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談話室

エクサフロップス時代の計算生物学

泰地真弘人

2014 年 54 巻 3 号 p. 172-174
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.172

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支部だより

支部だより

～中部支部からのお知らせ～

2014 年 54 巻 3 号 p. 175-176
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.175

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若手の会だより

若手の会だより

～理系学生にとってのビジネス文章～

2014 年 54 巻 3 号 p. 177-178
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.177

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海外だより

海外だより

～モントリオールでの研究生活～

2014 年 54 巻 3 号 p. 179-180
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.179

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用語解説

用語解説1

2014 年 54 巻 3 号 p. 139
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.139

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用語解説2

2014 年 54 巻 3 号 p. 166
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.166

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用語解説3

2014 年 54 巻 3 号 p. 171
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.171

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用語解説4

2014 年 54 巻 3 号 p. 174
発行日: 2014年
公開日: 2014/05/27

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.54.174

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